网站响应比较慢，如何排除？

我的网站是LNMP+fastcgi的架构；
问题一：我的网站放慢了我该如何定位到到底是php-fpm慢还是数据库的问题？
问题二：比如我在fpm慢日志看到我的一个方法，执行时间比较长（有可能是远程调用，有可能是数据库查询，也可能是文件写入比较多），那么我看到了这个慢的方法，我如何定位，到底是这个方法哪个环节比较慢（条件是我不能调试我的代码，我也不能在我代码里面加断点的情况）？
问题三：我看到我的服务器负载不高，但CPU和内存比较高，那我应该怎么排查到底是什么原因造成的？

回复内容：

我的网站是LNMP+fastcgi的架构；
问题一：我的网站放慢了我该如何定位到到底是php-fpm慢还是数据库的问题？
问题二：比如我在fpm慢日志看到我的一个方法，执行时间比较长（有可能是远程调用，有可能是数据库查询，也可能是文件写入比较多），那么我看到了这个慢的方法，我如何定位，到底是这个方法哪个环节比较慢（条件是我不能调试我的代码，我也不能在我代码里面加断点的情况）？
问题三：我看到我的服务器负载不高，但CPU和内存比较高，那我应该怎么排查到底是什么原因造成的？

如何定位到到底是php-fpm慢还是数据库的问题

如果使用的是Mysql，可以开启慢查询,来排查

问题一：通过php-fpm和mysql的cpu占用可以看出来是哪个导致的
问题二：如果php占用高则查看php的timeout和max_child优化php配置，如果mysql占用高，则查看my.cnf配置调优，优化之后，则查看慢查询日志，找出查询时间长的sql加以优化
问题三：同一二top找出占用资源的前几个
另外带宽和服务器的软硬件配置，和程序逻辑，还有是否被攻击也是需要考虑的要素
通过netstat -nat |grep 3306查看连接数排查也是个不错的选择